Het interieur vertoont duidelijke sporen van vele verbouwingen. In 1225 werd het kerkje op last van de families Badoer en Da Mula herbouwd.
Uit die periode dateren de plattegrond in de vorm van een Latijns kruis met drie beuken, en de door John Ruskin en Gabriele d`Annunzio zeer bewonderde groenmarmeren zuil met Ionisch kapiteel, buitgemaakt in Constantinopel tijdens de vierde kruistocht.
houten plafond in de vorm van een scheepsromp
Het prachtige houten plafond in de vorm van een scheepsromp dateert uit het begin van de vijftiende eeuw.
Houten plafonds waren niet alleen mooi om te zien, ze hadden ook een praktische functie.
Als 'temperatuurregelaars' boden zij bescherming tegen zowel de winterse kou als de zomerse hitte. Voor dit plafond werd larikshout gebruikt, vanwege zijn hygroscopische eigenschappen.
Dergelijke plafonds zijn nog te bewonderen in de kerken van Santo Stefano en San Polo.